Bonjour,
En principe, votre employeur peut suspendre votre contrat de travail s'il constate que vous n'êtes plus en situation régulière.
Or, ici, dans la mesure où vous aviez une carte de séjour pluriannuelle d'une durée d'au moins 4 ans dont vous avez sollicité le renouvellement, vous êtes toujours en situation régulière pendant une durée de trois mois et avez donc parfaitement la possibilité de continuer à travailler.
Cette règle figure à l'article L.433-3 du CESEDA :
"Lorsque l'étranger titulaire d'une carte de séjour pluriannuelle d'une durée de quatre ans, d'une carte de résident ou d'un titre de séjour d'une durée supérieure à un an prévu par une stipulation internationale en demande le renouvellement, il peut justifier de la régularité de son séjour entre la date d'expiration de ce document et la décision prise par l'autorité administrative sur sa demande par la présentation de la carte ou du titre expiré, dans la limite de trois mois à compter de cette date d'expiration."
Je vous conseille d'en parler avec votre employeur, pour le rassurer et lui confirmer que vous avez le droit d'exercer votre emploi.